Сотрудничество Русского музея с информационно-образовательными центрами «Русский музей: виртуальный филиал» строится по нескольким направлениям.
Первое из направлений - это организация и проведение различных мероприятий, целью которых является знакомство сотрудников виртуальных филиалов с реальным Русским музеем - с его музейным комплексом и экспозициями, а также установление партнерских связей друг с другом.
Другим направлением является организация обмена опытом, обсуждение и решение актуальных вопросов и проблем из жизни центров. В числе основных мероприятий данного направления - ежегодные семинары для сотрудников виртуальных филиалов на базе Русского музея, сеансы видеоконференцсвязи, тематические встречи участников проекта, стажировки.
Важным направлением деятельности, объединяющим Русский музей и информационно-образовательные центры, является осуществление совместных проектов и акций, проведение конкурсов, создание совместных мультимедийных материалов, которые обогащают медиатеку проекта "Русский музей: виртуальный филиал" в целом (и каждый виртуальный филиал в частности) новыми информационно-образовательными ресурсами.